Som en af verdens højest beliggende søer varierer vejret omkring Titicaca-søen afhængigt af sæsonen:
Vinter (juni til august)
Klart vejr med kolde nætter og kølige dage. Temperaturerne kan falde til frysepunktet om natten, men dagtemperaturerne ligger omkring 15°C.
Forår (september til november)
Mildere temperaturer og mindre regn. Dagtemperaturerne ligger mellem 15°C og 20°C, nætterne er stadig kølige.
Sommer (december til februar)
Varmere, men også regnsæson. Temperaturerne om dagen kan nå 20°C, men der er hyppigere regnbyger, især om eftermiddagen.
Efterår (marts til maj)
Overgangen fra regnsæson til tørtid. Temperaturerne er behagelige, omkring 15°C til 20°C om dagen, og regnbygerne bliver sjældnere.